- Lãnh đạo quản lý, điều hành Thanh tra viên, công chức thanh tra trong đơn vị thực hiện đúng chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của đơn vị trên các lĩnh vực được Giám đốc Sở phân công, phụ trách;

- Chỉ đạo công tác xây dựng chương trình, kế hoạch thanh tra trình Giám đốc Sở quyết định và tổ chức thực hiện chương trình, kế hoạch và thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn khác theo quy định của pháp luật;

- Chủ trì phối hợp với các phòng, đơn vị trực thuộc Sở; Thanh tra các sở, ngành trong tỉnh; Thanh tra Bộ; Tổng cục Tiêu chuẩn Đo lường Chất lượng; Cục An toàn bức xạ hạt nhân; Cục Sở hữu trí tuệ trong công tác thanh tra, giải quyết đơn thư khiếu nại, tố cáo và các nhiệm vụ khác;

- Giúp Giám đốc Sở xử lý chồng chéo các cuộc thanh, kiểm tra trong nội bộ Sở và thanh tra sở, ngành trong tỉnh; Bộ, Tổng cục, Cục...;

- Trưởng Đoàn thanh tra khi Giám đốc Sở yêu cầu và xử phạt vi phạm hành chính theo quy định của pháp luật;

- Giám sát hoạt động của đoàn thanh tra theo quy định;

- Triển khai công tác Pháp luật thuộc phạm vi thanh tra;

- Chịu trách nhiệm về quyết định, kết luận các vụ việc thanh tra của Đoàn thanh tra thuộc quyền quản lý;

- Phụ trách thanh tra Hành chính, trách nhiệm của Thủ trưởng phòng, đơn vị thuộc Sở trong việc thực hiện pháp luật về thanh tra; giải quyết khiếu nại, tố cáo và phòng, chống tham nhũng; chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và chuyển giao công nghệ;

- Trưng tập công chức, viên chức của cơ quan, đơn vị liên quan tham gia hoạt động thanh tra;

- Thực hiện nhiệm vụ khác theo chỉ đạo của Lãnh đạo Sở.