Ngày 20/4/2018, UBND tỉnh Quảng Ninh đã ban hành Quyết định số 1316/QĐ-UBND về việc sáp nhập Ban Quản lý Di tích và Danh thắng tỉnh vào Bảo tàng và kiện toàn cơ cấu tổ chức của Bảo tàng Quảng Ninh trực thuộc Sở Văn hóa Thể thao; Quyết định có hiệu lực kể từ ngày 1/5/2018. Theo đó:
Bảo tàng Quảng Ninh là đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Sở Văn hóa và Thể thao; thực hiện chức năng sưu tầm, bảo quản, nghiên cứu, trưng bày, giới thiệu di sản văn hóa, bằng chứng vật chất về lịch sử - văn hóa và thiên nhiên của tỉnh Quảng Ninh và Việt Nam phục vụ nhu cầu nghiên cứu, học tập, tham quan và hưởng thụ văn hóa của nhân dân trong tỉnh và du khách; hướng dẫn và tổ chức các hoạt động bảo vệ, phát huy giá trị di sản văn hóa trên địa bàn.
Bảo tàng Quảng Ninh có tư cách pháp nhân, con dấu và tài khoản riêng hoạt động theo quy định của pháp luật và chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức hoạt động, biên chế của Sở Văn hóa Thể thao và các cơ quan có liên quan.
Bảo tàng Quảng Ninh có Lãnh đạo Bảo tàng; 06 Phòng chức năng và 02 Trung tâm; số người làm việc gồm 63 viên chức, hợp đồng lao động 68 và hợp đồng lao động.
Bảo tàng hoạt động theo cơ chế tự chủ quy định tại Nghị định số 16/2015/NĐ-CP ngày 14/2/2015 của Chính phủ quy định cơ chế tự chủ của đơn vị sự nghiệp công lập và các quy định khác có liên quan. Sử dụng cơ sở vật chất, tài sản, phương tiện, trang thiết bị của Bảo tàng để làm việc. Trụ sở của Bảo tàng đặt tại thành phố Hạ Long, Quảng Ninh./.